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营业执照丢失后，不能直接进行公司注销，需要先补办营业执照，然后再进行注销流程。

补办营业执照的流程如下：

首先，需要登报说明，即去市级公开发行的报纸上刊登营业执照的遗失声明，并声明作废。
准备好以下材料：
公司法定代表人签署的《企业营业执照补发申请书》原件。
办理补办营业执照业务的经办人身份证复印件，需要验原件。
公司法定代表人签署的公司补办营业执照的决定文件原件。
根据公司具体情况，可能还需要提交其他文件，如公司章程、股东会决议等。
将上述材料提交给工商部门，等待审核。审核通过后，等待一段时间（通常为5个工作日左右）即可领取补办的营业执照。
在补办完营业执照后，可以按照正常的公司注销流程进行注销。具体的注销流程可能因地区和公司类型而异，但一般包括以下步骤：

召开股东会或董事会，形成注销公司的决议。
前往税务部门办理税务注销手续，包括清缴税款、注销税务登记证等。
前往工商部门办理工商注销手续，提交注销申请、注销报告等相关材料。
如有需要，还需前往其他部门（如社保、银行、海关等）办理注销手续。
在完成所有注销手续后，公司即被注销，不再具有法人资格。
请注意，以上流程仅供参考，具体流程可能因地区和公司类型而异。如有需要，建议咨询当地工商部门或专业律师。